港九小轮目前拥有一支由22艘渡轮所组成的船队。渡轮可按船体大小、载客量以及航速分为不同级别，满足不同航线的要求，为乘客提供安全及舒适的渡轮服务。
港九船队
海安级
型号 ： 32米高速双体船
长度 ： 32米
阔度 ： 8米
载客量 ： 402-413人
最高航速 ： 每小时24海浬
海耀级
型号 ： 32米高速双体船
长度 ： 32米
阔度 ： 8米
载客量 ： 390-399人
最高航速 ： 每小时24海浬
港九1
型号 ： 40米高速双体船
长度 ： 40米
阔度 ： 10.5米
载客量 ： 450人
最高航速 ： 每小时25海浬